Séquençage ADN - notions fondamentales
Durée
2 jours, 14 heures
Modalité
Objectifs
Comprendre les principes fondamentaux du séquençage de l'adn
Interpréter correctement les données de séquençage de l'adn
Prérequis
Connaissances de base en biologie moléculaire et en PCR
Public cible
Techniciens, Cadres, Biologistes
Financement
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Salariés
CDI, CDD, secteur privé
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Programme
Expliquer les principes du séquençage de l'adn
- Structure de l'ADN et organisation du génome
- Principe de la réplication de l'ADN et de la synthèse de chaîne d'ADN complémentaire
- Évolution des techniques de séquençage de l'ADN
Identifier les techniques de séquençage de l'adn
- Méthode de Sanger : principe et étapes du séquençage d'ADN par terminaison de chaîne
- Électrophorèse capillaire pour la séparation des fragments d'ADN séquencés
- Illumina
- Ion Torrent
- Les techniques en cours de développement
Définir les principes et les applications du séquençage nouvelle génération ngs
- Principe de la séquençage nouvelle génération (NGS)
- Différentes technologies de NGS (Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore)
- Applications du NGS en recherche génomique, en médecine et en biotechnologie
Analyser et interpréter les données de séquençage de l'adn
- Lecture des résultats de séquençage Sanger
- Analyse des données de séquençage NGS : alignement, variant calling, annotation
Analyser les défis et les perspectives de l'évolution des techniques de séquençage de l'adn
- Discussion sur les limitations actuelles et les domaines nécessitant des améliorations
- Exploration des perspectives futures, telles que le séquençage à nanopores et les approches de séquençage à lecture unique
Méthodes pédagogiques
Alternance de méthodes pédagogiques variées, adaptées aux différentes capacités à acquérir. Des cours magistraux permettront aux stagiaires d'acquérir les connaissances théoriques nécessaires, tandis que des travaux pratiques leur permettront de se familiariser avec les techniques d'analyse et de diagnostic. Des études de cas seront également proposées, afin d'encourager les stagiaires à développer leur esprit d'analyse et de synthèse.
Les parties théoriques se déroule en grand groupe d'apprenants. Les activités alternant entre cours magistraux
(méthode transmissive) ou de travaux dirigés sous forme d'étude de cas (méthode interrogative).
Des travaux pratiques (seul ou en petit groupe) avec le matériel adéquat (méthode active) permet de faire le
lien entre savoirs et savoir-faire pour permettre l'ancrage des nouvelles capacités professionnels.
Groupes composés d'environ 4 à 15 personnes
Modalités d'évaluation
Une évaluation formative sera réalisée tout au long du programme afin de permettre aux formateurs de fournir un retour régulier aux participants et de les aider à progresser dans leur apprentissage. Elle pourra prendre la forme d'exercices pratiques, de discussions de groupe ou de QCM.
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Avis et satisfaction
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