Techniques journalières en Mycologie
Durée
5 jours, 35 heures
Modalité
Prévoir une blouse pour les travaux pratiques.
Objectifs
Maîtriser les techniques de base appliquées en mycologie : prélèvement examen direct isolement
Identifier les espèces pathogènes les plus souvent isolées en mycologie médicale
Maîtriser les techniques de culture de microscopie et de diagnostic des principales espèces contaminantes apprécier leur rôle pathogène et leur importance en hygiène hospitalière
Prérequis
Expérience de travail en laboratoire (manipulation, usage du microscope...) ; Stage intensif - ouvert aux techniciens, cadres techniques et biologistes, y compris débutants - nécessitant une faculté d'assimilation rapide.
Public cible
Techniciens, Cadres, Biologistes
Financement
- OPCO
- France Travail
Programme
Définir les principes fondamentaux de la mycologie
- Introduction à la mycologie
- Généralité sur les champignons: définition des champignons et mycoses
- Classification : taxinomie des champignons d'intérêt médical
- MIse en évidence du champignon dans le produit pathologique : Méthodes de prélèvement et d'échantillonnage
Décrire l'épidémiologie des principales mycoses
- Champignons levuriformes : Candidoses, Cryptococcose, Pityriasis versicolor
- Dermatophytoses et pseudo-dermatophytoses
- etude des moisissures d'intéret médical :champignons filamenteux opportunistes
- Aspergilloses
Identifier les différents prélèvements la clinique associée et les différentes étapes de diagnostic
- Milieux de culture spécifiques pour les champignons
- Techniques ensemencement et d'isolement des champignons
- Conditions d'incubation et de croissance optimales
- Détection et gestion des contaminants dans les cultures fongiques
Appliquer les différents critères d'identification macroscopique et microscopique d'un champignon dans l'étude du diagnostic biologique des mycoses
- Préparation des échantillons pour l'observation microscopique
- Techniques de coloration spécifiques pour les champignons
- Interprétation des résultats microscopiques
- Etude macroscopique et microscopique dans l'identification fongique
Choisir et mettre en oeuvre les techniques appropriées pour contribuer à l'établissement d'un diagnostic mycologique
- Techniques phénotypiques d'identification des champignons
- Tests biochimiques pour l'identification fongique
- Utilisation de clés d'identification et de nouvelles technologie concernant les bases de données en mycologie
- Limitations et interprétation des résultats d'identification
- Identification des principales levures isolées au laboratoire: Candida sp., Cryptococcus sp., Trichosporum sp., Malassezia furfur ...
- Identification des principaux dermatophytes pathogènes
- Identification des aspergillacés et des champignons contaminants les plus souvent isolés
- Critères d'appréciation du rôle pathogène
Traiter et interpréter les résultats en fonction du rôle pathogène de l'épidémiologie et du contexte clinique
- Analyse de cas cliniques avec des résultats d'identification et de diagnostic
- Utilisation des résultats de laboratoire pour guider le traitement des infections fongiques
- Gestion des infections fongiques résistantes aux antifongiques
- Perspectives futures dans le diagnostic et le traitement des infections fongiques
Mettre en oeuvre les protocoles de gestion de la qualité en mycologie
- Gestion des controles de qualité internes et externes en mycologie
- Utilisation appropriée des contrôles positifs et négatifs
- Protocoles de biosécurité et gestion des déchets biologiques
- Bonnes pratiques de laboratoire en mycologie
Identifier les différents prélèvements, la clinique associée et les différentes étapes de diagnostic
- Milieux de culture spécifiques pour les champignons
- Techniques ensemencement et d'isolement des champignons
- Conditions d'incubation et de croissance optimales
- Détection et gestion des contaminants dans les cultures fongiques
Méthodes pédagogiques
Alternance de méthodes pédagogiques variées, adaptées aux différentes compétences à acquérir. Des cours magistraux permettront aux stagiaires d'acquérir les connaissances théoriques nécessaires, tandis que des travaux pratiques leur permettront de se familiariser avec les techniques d'analyse et de diagnostic. Des études de cas seront également proposées, afin d'encourager les stagiaires à développer leur esprit d'analyse et de synthèse.
Modalités d'évaluation
Une évaluation formative sera réalisée tout au long du programme afin de permettre aux formateurs de fournir un retour régulier aux participants et de les aider à progresser dans leur apprentissage. Elle pourra prendre la forme d'exercices pratiques, de discussions de groupe ou de QCM.
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